Le Syndicat Mixte est administré par un comité syndical composé de 5 délégués titulaires et de 2 délégués suppléants par communauté de communes, soit un total en assemblée plénière de 25 délégués. La fréquence de réunion est trimestrielle.

Les organes du Syndicat sont les suivants : le Président, le Bureau, le Comité syndical et les Commissions techniques.

Quatre commissions techniques ont été créées.
Elles sont animées chacune par un des vices – présidents.

Les thématiques ont été définies en fonction des domaines d’application :

• assainissement,
• eau potable,
• agriculture,
• aménagement et entretien de rivières.